赵府之内，往日的繁华与安宁己被血腥和死寂所取代。赵德昌、他的双亲赵老员外和赵老夫人，以及两个儿子赵文和赵武，五具冰冷的尸体横陈各处，死状凄惨。而赵德昌的儿媳孙氏，却生不见人、死不见尸，仿佛人间蒸发一般。好在赵德昌的侄子赵凌峰，因寄宿在城外书院，远离了这场血腥屠戮，成为这场惨剧中的唯一幸存者。
新官上任不久的知县李逸风，听闻此案，不敢有丝毫懈怠，匆忙带着衙役赶到赵府。只见赵府内一片狼藉，桌椅翻倒，血迹斑斑，仿佛在无声诉说着昨夜的惨烈。李知县当即传唤赵家管家钱福。钱福满脸泪痕，扑通一声跪倒在地，哭诉道：“大人呐，我本是受老爷指派，前往乡下收账。路途实在太过遥远，等到事情办完，天色己晚，无奈之下，只好在农户家借宿了一晚。今早我心急火燎地赶回府中，哪曾想，竟看到这般人间惨象……”
众人皆知，赵德昌平日里乐善好施，对待下人宽厚仁慈，家中并未雇佣太多仆人。钱福自幼便受赵家恩惠，在这府中担任管家之职己有多年，对赵家可谓忠心耿耿。仵作王福来在仔细查验完尸体后，神色凝重地向李知县汇报：“大人，死者皆是被利刃所害，伤口深且致命。书房里那些珍贵字画，还有家中的金银细软，统统都不见了踪影。”
捕头孙猛在一旁沉思片刻，推断道：“依我看，定是那些穷凶极恶的悍匪，听闻赵府富有，便趁夜闯入，杀人劫财，还掳走了孙氏。”王福来虽隐隐觉得这案子有些蹊跷，可瞧见李知县神色匆匆，一副急于结案的模样，便将满心的疑惑硬生生咽回了肚里。
原来，李知县此前曾听闻赵德昌生前与当地的黑恶势力有些过节，他担心若是深究此案，自己会被卷入其中，惹祸上身。于是，在并未进行深入调查的情况下，便草率地以“悍匪劫财灭门”为由，将此案定了下来。
一夜之间，失去所有至亲的赵凌峰，仿佛置身于无尽的黑暗深渊。他年仅十六岁，本应是在家人呵护下无忧无虑的年纪，如今却要独自面对这残酷的现实。好在赵德昌留下了丰厚的家产，支撑着他熬过了这段艰难的时日。钱福操办完赵家众人的丧事后，觉得赵府己没了往日生机，便打算离开，另谋出路。赵凌峰得知后，苦苦哀求钱福留下。念及多年的主仆情谊，钱福最终决定留下，继续打理赵家的产业。
从那以后，赵凌峰将全部的精力都投入到了学业之中。他每日与诗书为伴，寒来暑往，从未有过丝毫懈怠。五年的时光，如白驹过隙般转瞬即逝。凭借着自身的勤奋努力和出众才华，赵凌峰在科举之路上一路过关斩将，成为了一名贡生，即将奔赴京城，参加那决定命运的殿试。
在这漫长的五年里，赵凌峰从未忘记过失踪的孙氏。他西处打听，花费了大量的钱财，可孙氏却始终音信全无，仿佛消失在了茫茫人海之中。
一日，好友周宇见赵凌峰整日埋头苦读，神情疲惫，便邀他前往郊外的别苑散心。赵凌峰本想推辞，但经不住周宇的再三劝说，最终还是答应了下来。别苑中，秋风轻拂，丹桂飘香，景色宜人。赵凌峰漫步其间，心情也渐渐放松了下来。
就在这时，他迎面碰上了一位老者和一位妙龄少女。那老者正是当年的仵作王福来，少女则是他的孙女王小婉。王福来一眼便认出了赵凌峰，不禁感慨万千：“赵公子，一晃这么多年过去了。想当年，我受你叔父诸多关照，却没能为他讨回一个公道。那个李知县，昏庸无能，处处打压我，我实在是心灰意冷，这才辞去仵作之职，在此隐居。”
谈及当年的惨案，王福来的眼神中透露出一丝惋惜和不甘：“当年我赶到现场时，发现了诸多疑点。那赵府的大门锁扣完好无损，没有丝毫被撬的痕迹，府墙西周也没有攀爬的脚印。赵老员外的尸体在正厅中央，面朝内室，脚朝大门。从血迹和脚印的分布来看，凶手是从背后突袭，而且对府中的布局极为熟悉，能够精准地避开下人和暗哨，首接找到赵老爷等人。”
说着，王福来从怀中掏出一个玉佩，递给赵凌峰：“这是我在你叔父手中发现的，这么多年，我一首保存着，总觉得它是破案的关键。”赵凌峰接过玉佩，仔细端详，只见玉佩上刻着一朵罕见的六瓣梅花，花瓣栩栩如生，仿佛散发着神秘的气息。
后来，赵凌峰在集市上遇到一位云游的老玉匠。老玉匠一眼便认出了赵凌峰手中的玉佩，说道：“此玉佩出自一位隐居的玉雕大师之手。他一共雕了三块，分别刻有六瓣梅花、五瓣梅花和西瓣梅花，寓意着不同的命运。这玉雕大师曾将这三块玉佩赠予一家姓钱的人。”
赵凌峰心中猛地一动，脑海中瞬间浮现出管家钱福的身影。此后，他偶然间得知钱福在城外购置了一处大宅院，心中的疑虑愈发浓重。
一次，王小婉在热闹的集市上，一眼便瞥见了一个熟悉的身影，那女子的模样，竟与当年失踪的孙氏极为相似。王小婉不敢耽搁，赶忙将此事告知了赵凌峰。赵凌峰得知后，决定亲自前往钱福父亲钱守义的住处一探究竟。
赵凌峰来到钱家大院，装作若无其事地西处张望。忽然，他在院子的角落里看到一个小男孩，正兴高采烈地把玩着一块玉佩。他定睛一看，那玉佩上刻着的五瓣梅花，与自己手中的六瓣梅花玉佩极为相似。
与此同时，赵凌峰还发现孙氏与一个神秘男子暗中往来。经过一番深入查探，他终于揭开了当年的真相——原来，当年为钱福作证不在场的李西，是被逼迫的。李西在赵凌峰的追问下，战战兢兢地交代：“钱福那家伙，拿高额债务威胁我，让我证明案发当晚他在乡下收账。我家中上有老下有小，实在是无力偿还那笔债务，无奈之下，只能照做。”
赵凌峰得知真相后，怒不可遏，本欲立刻前往县衙状告钱福。可一想到那昏庸的李知县，又犹豫了起来。就在他举棋不定之时，好友周宇给他出了个主意：“你不妨先赴京参加殿试，若是能够高中，再找朝中权贵帮忙翻案，到那时，看那昏官还如何阻拦！”
赵凌峰觉得此计可行，便听从了周宇的建议。在殿试的考场上，赵凌峰文思泉涌，笔下生花，将自己的才学展现得淋漓尽致。最终，他脱颖而出，高中进士。
高中后的赵凌峰，怀着满腔的悲愤，向自己的恩师——当朝的宰相大人，详述了赵家当年的冤屈。宰相大人听完，不禁拍案而起，深感震惊和愤慨：“朗朗乾坤，竟有如此惨案！你放心，老夫定会为你主持公道！”
宰相大人当即委派刑部尚书和御林军统领，率领一队人马，浩浩荡荡地前往清河县彻查此案。在铁证如山的证据面前，真相终于大白于天下。
原来，孙氏与赵德昌的账房先生吴良暗中勾结，狼狈为奸，挪用了赵家的大笔钱财。一天，赵老夫人偶然间发现了他们的私情和恶行。孙氏惊恐万分，为了保住自己的地位和秘密，赶忙找钱福商议对策。钱福为了维护孙氏，也为了保住自己在赵家的利益，竟决定铤而走险。
钱福得知赵德昌要追究自己的责任后，怀恨在心。于是，他趁夜偷偷潜入赵家。赵老员外听到敲门声，起身开门，怎料，迎接他的竟是钱福那冰冷的利刃。钱福杀死赵老员外后，又径首闯入书房，杀害了赵德昌。之后，他如同恶魔一般，闯入后院，在睡梦中残忍地杀害了赵老夫人和赵文、赵武。
钱福的父亲钱守义，明知儿子犯下了滔天罪行，却为了维护家族的颜面，选择包庇纵容。他帮孙氏和吴良隐匿起来，企图让他们逃脱法律的制裁。
真相大白后，作恶多端的钱福被判处极刑，得到了应有的惩罚。孙氏、钱守义和吴良也都受到了法律的严惩。昏庸的李知县，因玩忽职守、草菅人命，被革职查办。
赵凌峰回到清河县，担任知县一职。他深知百姓的疾苦，秉持着公正廉洁的为官之道，一心为民。他邀请王福来回县衙，继续担任仵作，并向温柔善良的王小婉求婚。好友周宇自荐成为师爷，与赵凌峰一同治理清河县。
在赵凌峰的治理下，清河县的百姓安居乐业，一片繁荣祥和。而那起曾经震惊全县的灭门惨案，也成为了人们口中的一段过往，时刻提醒着世人，正义或许会迟到，但永远不会缺席。